舞臺是象征理性的「青之世界」然而正在遭受由本能支配的「紅之世界」的生命體NightflyO’Note的襲擊與侵略17歲的主人公麻黃Akira就職為青之世界研究員隨后因?yàn)槟芰Τ霰姸惶岚螢樽钋熬€的戰(zhàn)斗指揮官受命負(fù)責(zé)橫跨石垣島和西表島而構(gòu)成的對位相外防衛(wèi)機(jī)關(guān)通稱「琉球LAG」在那里她遇見了在第五戰(zhàn)斗單元經(jīng)過激戰(zhàn)而全軍覆滅之后于四年前成立的第六戰(zhàn)斗單元「IS」的學(xué)生們主人公作為教官率領(lǐng)著又稱「Scared Rider Xechs」的6名騎手（Rider）共同浴血奮戰(zhàn)應(yīng)對來自異世界的攻擊和威脅在這樣的生活中他們的友情也在逐漸加深